在游戏的发布之初，便提供了细菌、病毒、真菌、寄生虫、朊病毒、纳米病毒和生化武器七种病原体，统称为游戏的基本病原体。

细菌（Bacteria）：最常见的瘟疫病原体，潜力不可估量。作为所有病原体中最容易的种类，细菌的各项能力都很平均，既可以使用激进流法快速进化传染，也可以采取猥琐流法循序渐进地完成游戏。

病毒（Virus）：一个能够迅速突变和极其难控制的病原体。该病原体的特点便在于突变症状迅速，且退化要比其它的病原体花费额外的 DNA 点数，适合以激进流法的游玩方式来完成游戏。

真菌（Fungus）：真菌孢子很难在没有特殊能力下传播到远距离。因此，该病原体一大特点便是传染能力比较缓慢而低下，而其它能力与细菌没有什么差别，激进流和猥琐流两种玩法皆可通行。

寄生虫（Parasite）：寄生虫的生命形式会阻止常规感染所造成的DNA改变。因为这样，寄生虫能够产生的 DNA 点数要比它类病原体的要少，是一种不能够挥霍 DNA 点数的病原体。

朊病毒（Prion）：一种隐藏在大脑内、缓慢、微妙且极为复杂的病原体。该病原体的特点便是比较难以发现和治愈，同时对修正各项能力所能产生的效果要稍微逊色，游玩方法亦可遵循细菌的思路。

纳米病毒（Nano-Virus）：这是一种难以控制、内部设有自毁开关、纳米级的人造病毒。该病原体的前提背景就是从实验室泄露出来的，所以开局时便已启动解药的研发，时间紧为其一大特点。

生化武器（Bio-Weapon）极为致命的病原体。所到之处，横尸遍野。该病原体的特点是在不进化或突变任何症状的情形下，也可以造成感染者的死亡，而病原体的特殊能力可以抑制或扩张这一特性。

在基本病原体下，传染能力可分为动物性传播、空气传播、水源传播、血液传播和昆虫传播。

进化不同的传播特性不仅会增加感染者数量，同时传染性的提升还可以加快跨地区的传染，由此还可以获得加成的 DNA 点数。 虽然通常情况下进化一项传染能力可以提高病原体的传染力，但部分能力进化后则会有减弱传染力的情况，因而在进化前务必再三确认而后行。